Esko Ukkonen

RSS-syöte listasta

  1. Modular discovery of monomeric and dimeric transcription factor binding motifs for large data sets

    Toivonen, J., Kivioja, T., Jolma, A., Yin, Y., Taipale, J. & Ukkonen, E., 4 toukokuuta 2018, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 46, 8, 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  2. Seed-driven Learning of Position Probability Matrices from Large Sequence Sets

    Toivonen, J., Taipale, J. & Ukkonen, E., 2017, 17th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2017). Schwartz, R. & Reinert, K. (toim.). Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, 13 Sivumäärä 25. (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); painos 88).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  3. Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphs

    Salmela, L., Walve, R., Rivals, E. & Ukkonen, E., 15 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Bioinformatics. 33, 6, s. 799-806 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  4. Fast motif matching revisited: high-order PWMs, SNPs and indels

    Korhonen, J. H., Palin, K., Taipale, J. & Ukkonen, E., 15 toukokuuta 2017, julkaisussa : Bioinformatics. 33, 4, s. 514-521 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  5. Longest common substrings with k mismatches

    Flouri, T., Giaquinta, E., Kobert, K. & Ukkonen, E., 2015, julkaisussa : Information Processing Letters. 115, 6-8, s. 643-647 5 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  6. The Glanville fritillary genome retains an ancient karyotype and reveals selective chromosomal fusions in Lepidoptera

    Ahola, V., Lehtonen, R., Somervuo, P., Salmela, L., Koskinen, P., Rastas, P., Valimaki, N., Paulin, L., Kvist, J., Wahlberg, N., Tanskanen, J., Hornett, E. A., Ferguson, L. C., Luo, S., Cao, Z., de Jong, M. A., Duplouy, A., Smolander, O-P., Vogel, H., McCoy, R. C. & 27 muutaQian, K., Wong, S. C., Zhang, Q., Ahmad, F., Haukka, J. K., Joshi, A., Salojarvi, J., Wheat, C. W., Grosse-Wilde, E., Hughes, D., Katainen, R., Pitkanen, E., Ylinen, J., Waterhouse, R. M., Turunen, M., Vaharautio, A., Ojanen, S. P., Schulman, A. H., Taipale, M., Lawson, D., Ukkonen, E., Makinen, V., Goldsmith, M. R., Holm, L., Auvinen, P., Frilander, M. J. & Hanski, I., syyskuuta 2014, julkaisussa : Nature Communications. 5, 9 Sivumäärä, 4737.

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  7. Motif matching using gapped patterns

    Giaquinta, E., Fredriksson, K., Grabowski, S., Tomescu, A. I. & Ukkonen, E., 4 syyskuuta 2014, julkaisussa : Theoretical Computer Science. 548, s. 1-13 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  8. Mining the UKIDSS GPS: Star Formation and Embedded Clusters

    Solin, O., Ukkonen, E., Haikala, L. & Maisala, S., 2012, Astronomical Data Analysis Software and Systems XXI. Ballester, P., Egret, D. & Lorente, N. P. F. (toim.). Astronomical Society of the Pacific, Vuosikerta 461. s. 577-580 4 Sivumäärä (Astronomical Society of the Pacific Conference Series; painos 461).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinen

  9. Mining the VVV: star formation and embedded clusters

    Solin, O., Haikala, L. & Ukkonen, E., helmikuuta 2014, julkaisussa : Astronomy & Astrophysics. 562, 15 Sivumäärä, A115.

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  10. Motif Matching Using Gapped Patterns

    Giaquinta, E., Fredriksson, K., Grabowski, S. & Ukkonen, E., 2013, Combinatorial Algorithms: 24th International Workshop, IWOCA 2013, Rouen, France, July 10-12, 2013, Revised Selected Papers. Lecroq, T. & Mouchard, L. (toim.). Springer-Verlag, s. 448-452 5 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; painos 8288).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Edellinen 1 2 3 4 5 6 7 8 Seuraava