Veli Mäkinen

Henkilö

Valikoidut julkaisut

  1. Genome-Scale Algorithm Design: Biological Sequence Analysis in the Era of High-Throughput Sequencing

    Mäkinen, V. A. T., Belazzougui, D., Cunial, F. & Tomescu, A. I., toukokuuta 2015, Cambrigde University Press. 391 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Kirja/raporttiKirjaTieteellinenvertaisarvioitu

  2. Compressed representations of sequences and full-text indexes

    Ferragina, P., Manzini, G., Mäkinen, V. & Navarro, G., 2007, julkaisussa : ACM transactions on algorithms.. 3, 2, s. Art. 20

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  3. Dynamic entropy-compressed sequences and full-text indexes

    Mäkinen, V. & Navarro, G., 2008, julkaisussa : ACM transactions on algorithms.. 4, 3, s. art. 32 38 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  4. Compressed full-text indexes

    Navarro, G. & Mäkinen, V., 2007, julkaisussa : ACM Computing Surveys. 39, 1, s. Article No. 2

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  5. Indexing Graphs for Path Queries with Applications in Genome Research

    Sirén, J., Välimäki, N. & Mäkinen, V., 2014, julkaisussa : IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 11, 2, s. 375-388 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  6. Storage and Retrieval of Highly Repetitive Sequence Collections

    Mäkinen, V., Navarro, G., Sirén, J. & Välimäki, N., 2010, julkaisussa : Journal of Computational Biology. 17, 3, s. 281-308 28 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  7. Versatile succinct representations of the bidirectional Burrows-Wheeler transform

    Belazzougui, D., Cunial, F., Kärkkäinen, J. & Mäkinen, V., 2013, Algorithms – ESA 2013: 21st Annual European Symposium, Sophia Antipolis, France, September 2-4, 2013. Proceedings. Bodlaender, H. L. & Italiano, G. F. (toim.). Springer-Verlag, s. 133-144 (Lecture Notes in Computer Science; painos 8125).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  8. Rank and select revisited and extended

    Mäkinen, V. & Navarro, G., 2007, julkaisussa : Theoretical Computer Science. 387, 3, s. 332-347 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  9. Transposition invariant string matching

    Mäkinen, V., Navarro, G. & Ukkonen, E., 2005, julkaisussa : Journal of Algorithms. 56, s. 124-153 30 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  10. Computational pan-genomics: status, promises and challenges

    The Computational Pan-Genomics Consortium, Mäkinen, V. A. T. & Valenzuela, S. D. A., tammikuuta 2018, julkaisussa : Briefings in Bioinformatics. 19, 1, s. 118-135 18 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  11. Explaining a Weighted DAG with Few Paths for Solving Genome-Guided Multi-Assembly

    Tomescu, A. I., Gagie, T., Popa, A., Rizzi, R., Kuosmanen, A. E. & Mäkinen, V. A. T., joulukuuta 2015, julkaisussa : IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 12, 6, s. 1345-1354 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

  12. On the complexity of Minimum Path Cover with Subpath Constraints for multi-assembly

    Rizzi, R., Tomescu, A. I. & Mäkinen, V., 10 syyskuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, S9, s. S5

    Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Näytä kaikki (122) »

Valikoidut aktiviteetit

  1. BMC Bioinformatics (Lehti)

    Veli Mäkinen (Toimittaja (editor))
    20132016

    Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypitTiedelehden toimittaja

  2. IWOCA 2016

    Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean puheenjohtaja)
    2016

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  3. HITSEQ at ISMB/ECCB 2017

    Veli Mäkinen (Puhuja: pääpuhuja (keynote))
    25 heinäkuuta 2017

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  4. ECCB workshop on Computational Pan-Genomics

    Veli Mäkinen (Puhuja: pääpuhuja (keynote))
    4 syyskuuta 2016

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  5. German Conference on Bioinformatics 2015

    Veli Mäkinen (Puhuja: pääpuhuja (keynote))
    syyskuuta 2015

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  6. RECOMB 2018

    Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
    marraskuuta 2017joulukuuta 2017

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  7. WABI 2017

    Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
    2017

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  8. ISMB 2016

    Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
    2016

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  9. MFCS 2016

    Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
    2016

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  10. Recomb Comparative Genomics 2015 (RECOMB-CG 2015)

    Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
    2015

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  11. Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching

    Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
    2015

    Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Näytä kaikki (239) »

Uusimmat palkinnot

  1. Hyvä tutkija -palkinto 2007

    Veli Mäkinen (Vastaanottaja), 19 joulukuuta 2007

    Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Näytä kaikki (1) »

Viimeisimmät projektit

  1. Sekvenssianalyysin uudet menetelmät ja laajennukset

    Mäkinen, V.

    SUOMEN AKATEMIA

    01/09/201731/08/2021

    Projekti: Tutkimusprojekti

  2. Syöpägenetiikan tutkimuksen huippuyksikkö / Mäkinen

    Mäkinen, V.

    01/01/201531/12/2017

    Projekti: Tutkimusprojekti

  3. Syöpägenetiikan tutkimuksen huippuyksikkö

    Mäkinen, V.

    01/01/201231/12/2017

    Projekti: Tutkimusprojekti

Näytä kaikki (6) »

ID: 62021